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| 目的 利用在线生物信息数据库，组织和细胞水平实验探究SIM2基因在膀胱癌中的表达及涉及的临床意义。方法 通过UALCAN数据库分析SIM2基因在膀胱癌患者和正常膀胱组织中的表达差异，SIM2基因表达与膀胱癌患者淋巴结转移、分期、组织亚型等临床病理参数的关系；GEPIA数据库、HPA数据库、组织芯片和定量PCR技术验证SIM2基因在膀胱癌患者中的mRNA和蛋白表达差异；利用String数据库分析SIM2基因的蛋白相互作用及调控网络；Linked Omics数据库做SIM2相关分子的富集分析；TIMER和TISIDB数据库分析SIM2基因与肿瘤微环境免疫细胞浸润的关系。结果 UALCAN、GEPIA和HPA数据库结果显示，膀胱癌组织中SIM2基因的mRNA和蛋白水平的表达明显高于正常膀胱组织(P<0.05);UALCAN在线工具分析揭示，SIM2的表达与患者的淋巴结转移、病理类型、分期密切相关；免疫组织化学及定量PCR湿实验结果显示，SIM2蛋白和mRNA表达水平在膀胱癌组织中明显升高(P<0.05),但SIM2的表达与膀胱癌患者TNM分期和病理分级无相关性；String在线分析结果提示，与SIM2具有相互作用的蛋白涉及生物过程包括参与类泛素蛋白修饰、转录调控、蛋白水解等生物学过程；LinkedOmics富集分析表明，与SIM2正相关基因涉及TNF、NF-kappa B和JAK-STA等信号通路及多种生物学功能，包括细胞黏附分子结合，G蛋白偶联受体结合和细胞因子受体活性等；免疫细胞浸润水平显示SIM2的表达与树突状细胞等呈负相关。结论 通过在多种在线数据库及实验结果揭示SIM2基因在膀胱癌中高表达，可能为膀胱癌发生发展的重要分子靶点。 |
| 关键词: SIM2 膀胱癌 生物信息学 |
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| 基金项目:四川省大学生创新创业训练培训项目(编号：S201913705111)； 四川养老与老年健康协同创新中心科研项目(编号：YLZBZ2015)； |
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